甘肃作为中国重要的棉花产区之一，其有机棉纱的棉花主要产自以下地区：
张掖市：张掖市是甘肃省重要的棉花生产基地，这里的气候条件适宜棉花生长，所产棉花质量较高。
酒泉市：酒泉市也是甘肃的主要棉花产区之一，这里的棉花产量和质量都很好。
金昌市：金昌市虽然不是甘肃的主要棉花产区，但也有一定规模的有机棉种植。
武威市：武威市地处河西走廊，气候干燥，光照充足，适合有机棉的生长。
白银市：白银市也有一定规模的有机棉种植。
需要注意的是，有机棉的生产需要严格遵循有机农业的标准，包括不使用化学合成肥料和农药，保护生态环境等。因此，这些地区的有机棉纱在品质和环保方面都有一定的保障。